缅因猫兽的暴走，以及由此引发的重启。　　留下苦恼的芽心，太一等人前往数码世界。　　重逢的搭档数码宝贝们，失去了至今为止的全部记忆。　　即使如此也为了再次筑起羁绊，而伸出手去的被选召的孩子们，与回应此的数码宝贝们。　　但，唯有比丘兽即使进化为成长期，也依然表现出警戒……　　“所以说过去的事情我不知道啦！”　　面对比起自己更加优先关心他人的空的好意，比丘兽反而抱持着不信任感。　　对于因受伤而久久伫立的空，太一和大和找不到能对她说的话语。　　接下来，应该在数码世界做些什么才好——　　在商谈此事的众人面前，缅因猫兽突然现身，之后又消失了。他不知为何残留着原先的记忆，寻找着芽心，含泪彷徨着——　　看到这副景象，孩子们为了拯救缅因猫兽而对数码世界之旅下定了决心。但，他们的面前却出现了那个驱使黑暗四天王的男人的身影。　　此时，现实世界的西岛收到了姬川失踪的报告。

第四次忍界大战结束的两年后，此时此刻的漩涡鸣人（竹内顺子 配音）早已成为盖世英雄一般的人物，无论他走到哪里都受到女孩子和小朋友的喜爱与追捧，他似乎也有其享受这样喧嚣欢闹的氛围。与之相对，壁花小姐日向雏田（水树奈奈 配音）则始终站在角落里，默默注视着这个她喜欢了多年的男孩子。雏田亲手为鸣人织了围巾，怎奈无法鼓足勇气交给对方，喜欢的话语更难以说出口。某个夜晚，雏田的妹妹花火（浅井清己 配音）遭到不明身份之人劫持，带火的陨石则落在附近的山坡之上。为了救回花火，阻止地球毁灭，鸣人、雏田、小樱（中村千绘 配音）、鹿丸（森久保祥太郎 配音）和佐井奉命前去调查舍人（福山润 配音）的真身。在此过程中，鸣人不小心知晓了雏田的心意……

　　人到中年的投资公司老总严保久迎来了事业的巅峰期，家庭也幸福美满。得意的春风刮昏了严保久的头脑，妻子因他不戒烟酒而愤怒出走。严保久融资开发的瑞斯达游乐场被对手设计陷害，全面失败落到倾家荡产，狼狈不堪的他只好带着儿子当当流落街头，最终被人逼债，走投无路躲回农村老家。乡亲的淳朴和商战中的险恶形成了鲜明的对比，严保久决定重整旗鼓，从零开始，最终迎来事业的春天。

小酒馆玉之屋的女招待阿妙（宮下順子 饰），是一位美丽温良的女孩。某晚，她邂逅了足以改变她一生的男人——伊藤晴雨（山谷初男 饰）。伊藤是一个官能民俗学者，对古代花样百出的刑法有着深入的研究。他一度让自己几任妻子亲身再现这些刑罚，并将之拍成照片。阿妙为伊藤吊诡的世界所吸引，从此沉湎其中。这个看似柔弱的女子有着令人难以置信的忍耐力，为了超越伊藤的前妻，她可以忍受各种各样的酷刑。

2010年，曾经的小学生们已经步入大学，太一、阿和等人步上不同的人生道路（八神太一和石田大和将会成长为22岁），而就在此时，数码宝贝的研究者メノア(松冈茉优 配音)却告诉他们：“被选召的孩子们”长大成人后，数码宝贝也将随之消失…。预告中字幕表明这是“太一他们最后的故事” ，结尾则注明：献给所有和数码宝贝一起成长的“孩子”们，还有亚古兽注视着长大成人的太一的背影，“太一，你长大了呢”。

在一片宁静的小山村，少女渡濑明日菜（金元寿子 配音）时常站在山顶，用父亲留给她的神秘矿石作二极管，收听着来自外面世界的美妙音乐。在一次放学途中，明日菜遭到一头怪兽的袭击，关键时刻她被俊美少年瞬（入野自由 配音）救下，纯洁的友谊在少男少女之间开始萌芽。明日菜体味着友谊的甜蜜，却不知瞬在某天悄然离开人世。新来的男老师森崎龙司（井上和彦 配音）为孩子们讲述了死国的传说，明日菜这才意识到瞬正是来自另一个世界雅戈泰的人。森崎真实身份隶属某个神秘组织，他和明日菜的心中都有想要复活的人，于是经过一波三折，他们随着瞬的弟弟心一同来到了传说中的雅戈泰。

突袭世界的大灾难“第二次冲击”后，世界在废墟之上重建。14岁的少年碇真嗣被父亲碇元渡叫到第3新东京市。本以为能见到父亲迎接的他，却见到名为“使徒”的巨大生物与军队交火。危急之下，特务机关NERV的葛成美里将真嗣救下，并将其带往碇元渡所统领的NERV总部。但迎接真嗣的，却是是父亲冷酷地命令：驾驶称为“EVA”的巨大人型机器人与使徒战斗。

无垠的大海之中，一只因化学污染而导致基因变异的巨型鲨鱼，正在水下横行肆虐……经营化工厂的大老板杜衡想收购渔场开发海洋世界，为此在赌场下套，使渔场老板林海洋欠下大笔赌债。而林海洋正巧因为渔场被杜衡的化工厂污染一事，找上了杜衡的公司，却遭到了殴打和软禁。林海洋之子林凯孤身前去营救，偶遇了在暗中调查化工厂污染一事的工人之女裴露，两人再次被杜衡的手下控制。而此时，那只巨型变异鲨鱼已经变得更加狂躁，杜衡得知之后，丧心病狂的打算用林凯裴露等人作为诱饵，捕捉那只变异鲨鱼……波涛汹涌的大海之上，一艘载着杜衡和林凯裴露众人的捕鱼船，一场惊险残酷的猎杀与反猎杀，关于阴暗的人性和残酷的野性，在惊涛骇浪之间正式上演。无垠的大海之中，一只因化学污染而导致基因变异的巨型鲨鱼，正在水下横行肆虐……经营化工厂的大老板杜衡想收购渔场开发海洋世界，为此在赌场下套，使渔场老板林海洋欠下大笔赌债。而林海洋正巧因为渔场被杜衡的化工厂污染一事，找上了杜衡的公司，却遭到了殴打和软禁。林海洋之子林凯孤身前去营救，偶遇了在暗中调查化工厂污染一事的工人之女裴露，两人再次被杜衡的手下控制。而此时，那只巨型变异鲨鱼已经变得更加狂躁，杜衡得知之后，丧心病狂的打算用林凯裴露等人作为诱饵，捕捉那只变异鲨鱼……波涛汹涌的大海之上，一艘载着杜衡和林凯裴露众人的捕鱼船，一场惊险残酷的猎杀与反猎杀，关于阴暗的人性和残酷的野性，在惊涛骇浪之间正式上演。

本作是为了纪念在1996年起开始的《游戏王》系列漫画连载二十周年所推出的动画电影。

橘晶（渡部纱弓 配音）拥有着一副冷淡的外表，内心里却是和外表极不相称的天真和单纯。橘曾经是学校田径队的种子选手，却因为种种意外而选择了退出。之后，橘来到了名为“GARDEN”的家庭餐馆打工，餐馆的老板是一个名叫近藤正己（平田广明 配音）的男人，他离过一次婚并且有一个孩子。