白色斗篷、高礼帽，单片夹鼻眼镜。出现在午夜的高楼，留下拿走宝石的通知函。这是我们熟知的怪盗基德。在《名侦探柯南》里，他是不亚于工藤新一和江户川柯南的明星人物。而他的真实身份则是高中生黑羽快斗（山口胜平 配音），为了调查父亲的失踪事件，扮起了父亲之前扮演的角色——怪盗基德，希望引出神秘组织的出现，进而调查出事情的真相。

幽灵军团的黄泉（中村秀利 配音）通过神秘的暗黑医疗术，复活了具有足以毁灭世界恐怖力量的魔物魍魉（加藤精三 配音），希望以此建立黑暗的千年王国。魍魉俯身于黄泉身上，随即命令幽灵军团攻打鬼之国，企图杀害具有封印魔物和预言死亡能力的巫女紫苑（藤村歩 配音），并准备夺回魍魉封印在沼之国的肉体。一旦魍魉的灵魂和肉体合二为一，世界将彻底灭亡。鬼之国遇袭的消息很快传到其他各国，叶隐村的忍者也被调动起来。鸣人（竹内顺子 配音）、小樱（中村千绘 配音）、宁次（遠近孝一 配音）和小李（増川洋一 配音）受命前去保护紫苑。然而，鸣人却从紫苑的口中得到他将死去的预言……　　本片为《火影忍者》第四部剧场版动画。